准备阶段：登录企业工商注册所在地的建设主管部门网站，下载并填写农林设计资质申请表。同时准备申请材料，包括企业法人营业执照、组织机构代码证、税务登记证等基本证件；公司章程、财务报表等证明企业运营情况的文件；专业技术人员的相关资质证书，如工程师职称证书、学历证明等；工程业绩证明材料（如有）；以及其他根据地方规定可能需要提供的文件。
提交申请：填写资质申请表，并按要求上传电子版材料，然后打印纸质版申请表和其他必要文件。向所在地的建设厅主管部门提交纸质文件，并缴纳相应的申请费用。
初步审查：建设厅主管部门会对申请材料进行初步审查，并签署初审意见。
上报省级主管部门：初审通过后，申请材料连同初审意见一起上报至省级建设主管部门，省级建设主管部门将进一步审核。
公示审核结果：审核通过后，省级建设主管部门将在其网站上公示审核结果。公示期间，任何单位和个人都可以提出异议。
颁发资质证书：如果没有收到有效异议，或者异议被解决后，企业将获得相应的农林设计资质证书。
需要注意的是，新企业首次申请时，一般只能申请最低级别（如乙级），后续可根据业绩和能力逐步升级。申请过程中，具体要求可能会有所调整，建议企业及时关注当地政策变化，并咨询当地的建设主管部门或专业服务机构，以确保申请顺利进行。